El colegio Señor de Animas fue fundado en 1987 en el distrito de San Juan de Miraflores por las profesoras Hermelinda Patiño Deza e Hilda Patiño Deza.
Inicia sus actividades el 1° de Marzo de ese año en la calle La Florida 155 Mz. D Lt. 24, AA.HH 13 de Octubre en Pampas de San Juan, San Juan de Miraflores. El propósito de la institución era y es ofrecer una formación integral comprometida con la Fe, la verdad y el conocimiento.
La Institución inició sus labores Educativas con el nivel Inicial y primer grado de primaria con un total de 25 alumnos y dos profesoras. Según transcurrieron los años se fueron incrementando los grados, egresando la primera promoción de sexto grado en el año 1992.

Posteriormente en 1993, se apertura el nivel educativo secundario y en el año de 1997 egresa la primera promoción de jóvenes que a la fecha son profesionales y padres de familia de su alma máter. En el año 2006 se adquirió un segundo local, donde se trasladó el nivel Inicial y Primaria.

En la actualidad el colegio cuenta con tres niveles educativos: Inicial, Primaria y Secundaria, y tiene alrededor de 300 alumnos. Actualmente La dirección está a cargo de Waldemar Patiño Gudiel Magister en Educación.